Lander-Waterman公式

Lander-Waterman 公式

Lander-Waterman formula是由Eric Lander 和 Michael Waterman于1980年提出，用于基因组组装中参数估计。

# The Lander/Waterman formula用来计算覆盖度。
# 公式的一般形式:
    C = LN / G
# C 覆盖度(coverage)
# G 单倍型基因组长度(haploid genome length)
# L 读段长度(read length)
# N 读段总数(number of reads)

参考

computational biology in Brown university Micheal Waterman web UCSD shortgun Illumina coverage